1. Enfoque simplificado de la organización

Todos los autores de esta escuela conciben la organización sólo en términos formales, un tanto rígidos, sin atribuir la debida importancia a su contenido social y psicológico.

2. Ausencia de trabajos experimentales

Los autores de la Escuela Anatómica no se caracterizaron por seguir un método rigurosamente “científico”, tal como ellos pretendían.

3. La «teoría de la máquina»

Consideran el comportamiento de la empresa como el comportamiento de una máquina que, tras recibir determinadas órdenes, siempre produce los mismos resultados.

4. Excesiva jerarquización

Se observa, especialmente en Fayol, cierta obsesión por la unidad de mando, en claro contraste con la supervisión funcional de Taylor.